בשל אופי פעולתן, היט"אות משמשות כבית גידול לחיידקים, על מנת למנוע ביעילות ובשיטתיות התפתחות מיקרואורגניזמים במערכת, יש להקפיד על תחזוקה רציפה. 
מעבר להקפדה על תחזוקה שוטפת, ניתן, במידת הצורך, לשפץ את היט"אות.

מלאכת השיפוץ כוללת ניקוי ושטיפת היחידה, לרבות סוללות, צביעת היחידה - פנים וחוץ, יציקת מגש והחלפת הבידוד, והכול תוך כדי שימוש בחומרים ייחודיים, פרי פיתוחה של Blygold international , המכילים תוסף אנטי בקטריאלי למניעת התפתחות מיקרואורגניזמים.

מעבר לניקוי ומניעת צמיחת בקטריות, ספיקת היחידה משתפרת לעין ערוך, דבר המייעל את מערכות המיזוג ומאפשר חיסכון בעלויות ההפעלה.

בסופו של תהליך מתקבלת יט"א מחודשת. כך ניתן לנשום לרווחה מתוך ידיעה כי האוויר בחדר צלול ובריא.